<link rel="stylesheet" href="styles.cf390c6bfbe7555f.css">

Targeted mass spectrometry analysis of Clostridium perfringens toxins

dc.contributor.authorĎuráčová, Miloslava
dc.contributor.authorKlimentová, Jana
dc.contributor.authorMyslivcová Fučíková, Alena
dc.contributor.authorZídková, Lenka
dc.contributor.authorSheshko, Valeria
dc.contributor.authorŘehulková, Helena
dc.contributor.authorDresler, Jiří
dc.contributor.authorKročová, Zuzana
dc.date.accessioned2026-08-18T12:31:32Z
dc.date.issued2019
dc.description.abstractTargeted proteomics recently proved to be a technique for the detection and absolute quantification of proteins not easily accessible to classical bottom-up approaches. Due to this, it has been considered as a high fidelity tool to detect potential warfare agents in wide spread kinds of biological and environmental matrices. Clostridium perfringens toxins are considered to be potential biological weapons, especially the epsilon toxin which belongs to a group of the most powerful bacterial toxins. Here, the development of a target mass spectrometry method for the detection of C. perfringens protein toxins (alpha, beta, beta2, epsilon, iota) is described. A high-resolution mass spectrometer with a quadrupole-Orbitrap system operating in target acquisition mode (parallel reaction monitoring) was utilized. Because of the lack of commercial protein toxin standards recombinant toxins were prepared within Escherichia coli. The analysis was performed using proteotypic peptides as the target compounds together with their isotopically labeled synthetic analogues as internal standards. Calibration curves were calculated for each peptide in concentrations ranging from 0.635 to 1101 fmol/uL. Limits of detection and quantification were determined for each peptide in blank matrices.eng
dc.description.abstract-translatedCílená proteomická analýza se postupně stala technikou pro detekci a absolutní kvantifikaci proteinů, jinak těžce dosažitelných klasickým bottom-up přístupem. Díky tomu byla zvolena jako vynikající přístup pro detekci potenciálně bojově zneužitelných agens v široké škále komplexních biologických a environmentálních matricích. Toxiny Clostridium perfringens mohou být potenciálně zneužitelné jako biologická zbraň, zejména pak epsilon toxin, který patří do skupiny nejúčinnějších bakteriálních toxinů. V publikaci je popsán vývoj metody cílené proteomické analýzy pro detekci toxinů Clostridium perfringens (alfa, beta, beta2, epsilon a iota). Pro analýzu byl použit vysokorozlišující hmotnostní spektrometr s kvadrupólovým analyzátorem a Orbitrapem, pracujícím v módu monitorování paralelních reakcí. Z důvodu nedostupnosti komerčně dodávaných standardů bakteriálních toxinů byly tyto pro další analýzy připraveny rekombinantně v E. coli. Kvantifikační analýza byla provedena pomocí využití syntetických izotopicky značených analogů sledovaných peptidů. Pro každý sledovaný peptid byly vytvořeny kalibrační křivky v rozsahu koncentrací od 0.635 to 1101 fmol/uL. V blankové matrici byly určeny též limity detekce a kvantifikace každého zvoleného peptidu.cze
dc.formatp. 1-18
dc.identifier.doi10.3390/toxins11030177
dc.identifier.issn2072-6651
dc.identifier.obd43875167
dc.identifier.scopus2-s2.0-85063712474
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12603/3141
dc.identifier.wos000464472400001
dc.language.isoeng
dc.peerreviewedyes
dc.publicationstatuspostprint
dc.publisherMDPI-Molecular diversity preservation international
dc.relation.ispartofToxins, volume 11, issue: 3eng
dc.relation.publisherversionhttps://www.mdpi.com/2072-6651/11/3/177
dc.rights.accessOpen Access
dc.rights.licenseCC BY
dc.source.urlhttps://www.mdpi.com/2072-6651/11/3/177
dc.subjectmass spectrometryeng
dc.subjectPRMeng
dc.subjectClostridium perfringenseng
dc.subjectprotein toxineng
dc.subjectepsilon toxineng
dc.subjecthmotnostní spektrometriecze
dc.subjectPRMcze
dc.subjectClostridium perfringenscze
dc.subjectproteinový toxincze
dc.subjectepsilon toxincze
dc.titleTargeted mass spectrometry analysis of Clostridium perfringens toxinseng
dc.title.alternativeCílená hmotnostně spektrometrická analýza toxinů Clostridium perfringenscze
dc.typearticle

Soubory